CGH ARRAY

آموزش تکنیک CGH ARRAY

• آموزش تکنیک CGH ARRAY با تیم ژن های طلایی
• کارشناسی سیستم شما با ما
• خرید دستگاه مورد نیاز برای مرکز شما با ما
•  اسلاید و بافرهای مخصوص تکنیک با ما
•  

آموزش تکنیک CGH ARRAY  توسط بهنیا صادقی

تکنیک aCGH (Array Comparative Genomic Hybridization) یک روش پیشرفته در سیتوژنتیک است که برای شناسایی تغییرات عددی و ساختاری در ژنوم استفاده می‌شود. در ادامه، به توضیح این تکنیک و کاربردهای آن می‌پردازم:
مقدمه
aCGH یک روش تحلیلی است که به محققان اجازه می‌دهد تا تغییرات ژنتیکی را در سطح کل ژنوم بررسی کنند. این تکنیک به ویژه برای شناسایی حذف‌ها، تکرارها و تغییرات دیگر در کروموزوم‌ها مفید است.
مراحل انجام aCGH
تهیه نمونه: ابتدا DNA از نمونه‌های مورد نظر (مانند بافت تومور یا نمونه‌های خون) استخراج می‌شود.
برچسب‌گذاریDNA

 DNA استخراج شده به دو بخش تقسیم می‌شود. یکی از آنها با فلوروفور (مولکول‌های نوری) سبز برچسب‌گذاری می‌شود و دیگری با فلوروفور قرمز.
هیبریداسیون: 

هر دو نمونه برچسب‌گذاری شده به یک میکروچیپ حاوی پروب‌های DNA متصل می‌شوند. این پروب‌ها به نواحی خاصی از ژنوم متصل می‌شوند.
تحلیل داده‌ها: پس از هیبریداسیون، شدت نور فلورسانس در هر ناحیه اندازه‌گیری می‌شود. نسبت شدت نور سبز به قرمز نشان‌دهنده تغییرات در تعداد کپی‌های DNA در ناحیه خاصی از ژنوم است.

کاربردها
تشخیص اختلالات ژنتیکی: aCGH می‌تواند برای شناسایی اختلالات ژنتیکی مانند سندرم‌های کروموزومی، ناهنجاری‌های مادرزادی و اختلالات رشد استفاده شود.
تحلیل تومورها: این تکنیک در سرطان‌شناسی برای شناسایی تغییرات ژنتیکی در تومورها و ارزیابی پیش‌آگهی بیماران کاربرد دارد.
پژوهش‌های ژنتیکی: aCGH به محققان کمک می‌کند تا درک بهتری از ساختار و عملکرد ژنوم‌ها به دست آورند.

مزایا و معایب
مزایا:

توانایی شناسایی تغییرات در سطح کل ژنوم
دقت بالا در تشخیص تغییرات عددی و ساختاری
سرعت و کارایی بالا در مقایسه با روش‌های سنتی
معایب:

هزینه‌های بالای تجهیزات و مواد مصرفی
نیاز به تحلیل دقیق داده‌ها و تفسیر نتایج
نتیجه‌گیری
تکنیک aCGH یک ابزار قدرتمند در سیتوژنتیک و ژنتیک پزشکی است که به شناسایی تغییرات ژنتیکی کمک می‌کند. این روش به ویژه در تشخیص اختلالات ژنتیکی و تحلیل تومورها کاربرد دارد و می‌تواند به پیشرفت‌های قابل توجهی در علوم پزشکی منجر شود.

تفاوتی بین aCGH و روش‌های سیتوژنتیک سنتی وجود دارد؟

تفاوت‌های اصلی بین aCGH (Array Comparative Genomic Hybridization) و روش‌های سیتوژنتیک سنتی به شرح زیر است:
1. دقت و حساسیت
aCGH: دارای دقت بالاتری در شناسایی تغییرات عددی و ساختاری در سطح کل ژنوم است. این تکنیک می‌تواند تغییرات کوچک، مانند حذف‌ها و تکرارهای کوچک را شناسایی کند.
روش‌های سنتی: مانند کشت سلولی و رنگ‌آمیزی کروموزوم‌ها، معمولاً تغییرات بزرگ‌تر (مانند ناهنجاری‌های کروموزومی) را شناسایی می‌کنند و دقت کمتری در شناسایی تغییرات کوچک دارند.
2. محدوده تحلیل
aCGH: می‌تواند کل ژنوم را به صورت همزمان بررسی کند و تغییرات در تمامی کروموزوم‌ها را شناسایی کند.
روش‌های سنتی: معمولاً به بررسی تعداد محدودی از کروموزوم‌ها یا نواحی خاص محدود می‌شوند و نمی‌توانند کل ژنوم را به صورت همزمان تحلیل کنند.
3. زمان و کارایی
aCGH: به دلیل انجام تحلیل‌های همزمان، معمولاً سریع‌تر از روش‌های سنتی است.
روش‌های سنتی: ممکن است زمان‌بر باشند، زیرا نیاز به کشت سلولی و مراحل مختلف رنگ‌آمیزی دارند.
4. تفسیر داده‌ها
aCGH: نیاز به تحلیل داده‌های پیچیده و نرم‌افزاری دارد که ممکن است نیاز به تخصص بیشتری داشته باشد.
روش‌های سنتی: تحلیل‌ها معمولاً ساده‌تر هستند، اما ممکن است به تفسیر تجربی وابسته باشند.
5. هزینه
aCGH: معمولاً هزینه‌های بالاتری دارد به دلیل نیاز به تجهیزات پیشرفته و مواد مصرفی.
روش‌های سنتی: ممکن است هزینه کمتری داشته باشند، اما به تجهیزات و زمان بیشتری نیاز دارند.
6. کاربردها
aCGH: به طور خاص برای تشخیص اختلالات ژنتیکی، تحلیل تومورها و تحقیقات ژنتیکی استفاده می‌شود.
روش‌های سنتی: بیشتر برای شناسایی ناهنجاری‌های کروموزومی و تحلیل‌های پایه استفاده می‌شوند.
نتیجه‌گیری
aCGH به عنوان یک تکنیک پیشرفته، مزایای قابل توجهی نسبت به روش‌های سنتی سیتوژنتیک دارد، اما انتخاب بین این دو بستگی به نیاز خاص تحقیق یا تشخیص دارد.

دستگاه‌ها
میکروچیپ‌های aCGH:
انواع مختلفی از میکروچیپ‌ها وجود دارد که پروب‌هایی برای نواحی خاص ژنوم دارند. این میکروچیپ‌ها معمولاً توسط شرکت‌های مختلف تولید می‌شوند.
اسکنرهای فلورسانس:

دستگاه‌هایی مانند Agilent SureScan و Illumina HiScan برای اندازه‌گیری شدت نور فلورسانس و تحلیل داده‌های هیبریداسیون استفاده می‌شوند.
کنترلرهای دما:

دستگاه‌هایی که دما را در طول هیبریداسیون کنترل می‌کنند تا شرایط بهینه برای واکنش‌ها فراهم شود.
دستگاه‌های استخراج DNA:

مانند Qiagen QIAamp و Thermo Fisher Scientific برای استخراج DNA از نمونه‌ها.
نرم‌افزارها
NimbleGen Software:

برای طراحی میکروچیپ‌ها و تحلیل داده‌های aCGH.
Agilent Feature Extraction:

نرم‌افزاری برای استخراج داده‌های فلورسانس از اسکنرها و تحلیل اولیه داده‌ها.
Genome Studio:

نرم‌افزار مربوط به Illumina برای تحلیل داده‌های aCGH و تفسیر نتایج.
DNA Analytics:

نرم‌افزاری برای تحلیل و تفسیر داده‌های aCGH.
R و Bioconductor:

مجموعه‌ای از بسته‌های نرم‌افزاری برای تحلیل داده‌های بیوانفورماتیک، شامل داده‌های aCGH.
Cytogenomics:

نرم‌افزاری برای تحلیل داده‌های سیتوژنتیک و aCGH.
نتیجه‌گیری
استفاده از این دستگاه‌ها و نرم‌افزارها به محققان کمک می‌کند تا به‌طور مؤثر و دقیق تغییرات ژنتیکی را شناسایی و تحلیل کنند.

آموزش نرم افزار های ژنتیک